Bioteknologi tidak selalu aman bagi lingkungan,tanaman hasil rekayasa genetik(transgenjk)juga dikhawatirkan menimbulkan ancaman terhadap ingkungan karena

[tex] Rekayasa \: Genetika, Bioteknologi [/tex]

Ancama terhadap lingkungan yaitu dengan adanya tanaman transgenik akan menyebabkan dapat timbulnya kerusakan dan ketidakseimbangan ekosistem. Mengapa bisa terjadi? Hal ini terjadi karena dengan menyemprotkan plastida, maka gen tanaman tersebut akan memiliki efek plastida yang dapat menyebabkan kematian beberapa hewan seperti larva kupu-kupu raja pada jagung Bt.